環境生態工程專業以習近平新時代中國特色社會主義思想為指導，立足巴彥淖爾，面向自治區等中西部地區，為區域經濟社會發展培養德、智、體、美、勞全面發展，具有可持續發展理念，掌握生態學、環境學、濕地學、土壤學、恢復生態學及生態工程設計等基礎理論知識和技能，能夠在各級政府環保部門、規劃部門、建設管理部門、農業、國土資源、保護區、城市建設、環境工程公司、高等院校等從事環境生態學研究、環境生態工程設計與管理、濕地保護設計與管理、生態恢復、生態環境監測、生態規劃設計、環保產品開發等方面具有專業特長的高素質應用型人才。
環境生態工程專業現有專任教師8人，其中副教授1人，講師7人，具有博士學位教師3人，全部教師都具有碩士及以上學位。
2018年以來,環境生態工程專業教師主持/參與教研科項目十余項，發表論文十余篇，參編出版專著3部，教材2部。
環境生態工程專業現有植物生態學實驗室、無機化學實驗室、有機化學實驗室、環境與資源實驗室等9個校內實驗室。校內實驗實訓場所總面積963平米，儀器設備價值253萬元,可滿足本專業校內實踐教學活動。
為加強學生實踐能力的培養，環境生態工程專業與內蒙古臨河黃河國家濕地公園、磴口縣奈林湖國家濕地公園等企事業單位，先后共建20個實習基地，滿足學生的實習與就業需求。
